满足经济社会可持续发展的环境保护要求，围绕重大区域、流域的环境、生态及核设施安全问题，面向改善环境质量、防范环境风险和保护公众健康目标，深化对典型环境过程的认识，形成针对多污染物及多介质的污染减排、质量改善、风险防范、监督执法、环保产业等科技支撑体系，实现环保科技全方位的跨越发展以及部分领域的赶超引领。
(一)从我国突出的环境问题出发，进一步探明区域、流域环境污染的成因和调控机理，揭示区域、流域生态系统退化与生物多样性保护和修复机理与机制，初步构建我国环境污染物健康风险评估与控制理论体系，夯实符合我国国情和社会发展需要的国家环境基准体系，引领国家中长期环境保护工作重点和方向。
(二)突破天地一体化的环境监测与预警、清洁生产、末端治理和生态修复成套技术100套以上，重要授权专利300项以上。创新流域、区域和行业环境管理模式，形成技术政策30项以上，技术标准100项以上，全面满足国家中长期环境保护技术需求。
(三)新建一批国家环境保护重点实验室和科学观测研究站，建设完善一批国家环境保护工程技术中心，建成环保科技基础数据和信息共享平台。争取新建1～2个国家重点实验室、国家工程技术中心或国家工程实验室。科技人才队伍规模稳步扩大，科技人才的国际国内竞争力显著提高，形成一支结构合理、适应国家环境保护事业发展需要的创新型环保科技人才队伍。
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